Docente
Area di ricerca
Architetture dei sistemi di elaborazione
Keyword (max 3 separate da virgola)
Comressione, Virtual Screening, Molecole, Drug Discovery
Sito web del progetto
Tecnologie da utilizzare
Python, C++
Descrizione (max 500 caratteri)
Il progetto tratterà l’analisi e implementazione di varie tecniche di compressione (e decompressione) della rappresentazione di molecole candidate come possibili farmaci. Le molecole sono rappresentate in un formato standard, chiamato SMILE, con una stringa che ne rappresenta la struttura (e non solo le componenti atomiche). Scopo del progetto è quello di analizzare diverse possibilità di compressione per ridurre lo spazio occupato su disco in caso di esperimenti su larga scala.
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-40511-2_5
Il progetto è legato ad un ambito di ricerca più ampio su tecniche ottimizzate per sistemi HPC a supporto dello screening virtuale di molecole per scoperta di nuovi farmaci, correntemente in uso per contrastare la pandemia COVID-19.
Nessuna conoscenza di dominio chimico-farmaceutico è necessario per questo progetto.